OMEGAPLUS奥鲑冠（omegaplus奥鲑冠***）

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本文目录一览：

• 1、群体进化选择消除分析
• 2、群体选择信号分析

群体进化选择消除分析

负选择（negative selection）：指群体中出现有害突变等位基因时，携带该等位基因的个体会因为生存力或育性降低而从群体中淘汰，也叫净化选择。

群体进化分析入门必名词解释 （出处： 生信技能树）在一个群体中，某类等位基因占该基因位点上全部等位基因数的比率。群体中某一基因型个体占群体总个数的比例。可以反映某一基因型个体在群体中的相对数量。

群体选择分析是在群体水平在基因组不同区域遗传多样性的差异。

现代综合进化论彻底否定获得性状的遗传，强调进化的渐进性，认为进化是群体而不是个体的现象，并重新肯定了自然选择的压倒一切的重要性，继承和发展了达尔文进化学说，能较好地解释各种进化现象。

●LD衰减分析的应用 评估群体特性和选择强度：驯化选择会导致群体遗传多样性下降，位点间的连锁程度更高。所以，通常驯化程度越高选择强度越大的群体，LD衰减速度也越慢。例如商品化群体比自然群体通常更大的LD衰减距离。

有强调绝灭率之差的模式，有强调群体增殖率之差的模式。有的认为雌雄选择为群体选择之一，也有的认为群体选择这一术语，只有当群体作为繁殖群体部分地被隔离的情况下，才能适用。

群体选择信号分析

1、其中，θπA和θπB分别代表A群体和B群体的θπ值。θπ比率大于1， 反映A群体的基因组杂合度大于B群体的杂合度，则B群体相应基因组区域受到选择。

2、前提：染色体要有重组！Y和W染色体不能用这种方法 本文只写两个群体之间的单倍型选择信号检测，单个群体内部的不写，但是rehh也可以做，很方便 rehh是一个R包 第一列个体名，后面每一列一个SNP。

3、多样性水平在亚群间比较，一般包括线性相关分析、亚群体间的差异比较两类。动植物重测序多是后者。Fst/pi ratio基于pi值。前面pi/fst等都是基于SNP位点的多态性来检测潜在的选择信号区域。

4、XP-CLR 利用了两个群体之间的多基因座等位基因频率差异（multilocus allele frequency differentiation）建立模型，使用布朗运动来模拟中性下的遗传漂移，并使用确定性模型来近似地对附近的单核苷酸多态性（SNPs）进行选择性扫描。

5、负选择会对正选择有一定的干扰作用，都能产生大量的低频突变，但是正选择会产生相对较多的高频突变。多样性水平在亚群间比较，一般包括线性相关分析、亚群体间的差异比较两类。动植物重测序多是后者。Fst/pi ratio基于pi值。

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